1、教育部人文社科重点研究基地“嘉兴学院中国共产党革命精神与文化资源研究中心”
2、教育部全国高校思想政治理论课教师社会实践研究基地
3、浙江省中国特色社会主义理论研究中心嘉兴学院基地
4、浙江省哲学社会科学重点研究基地“嘉兴学院浙江省中国共产党创建史研究中心”
5、浙江省2011协同创新中心“浙江省红色文化研究与传承协同创新中心”
6、浙江省新型高校智库“长三角一体化研究中心”
7、教育部-中兴通讯ICT产教融合创新基地(嘉兴学院)
8、浙江嘉兴光伏应用技术创新服务平台
9、浙江省院士专家工作站(嘉兴学院)
10、浙江高校产学研联盟秀洲中心
11、浙江省嘉兴皮毛产业技术创新服务平台
12、浙江省海盐标准件技术创新服务平台
13、浙江省平湖光机电技术服务创新平台
14. 浙江省纱线材料成型与复合加工技术研究重点实验室
15. 浙江省芳烃磺酸工程技术研究中心
16、国家级住院医师规范化培训基地(附属中医医院)
17、国家级住院医师规范化培训基地(附属第一医院)
18、国家级住院医师规范化培训基地(附属第二医院)
19、国家级临床重点专科:眼科学(附属中医医院)